通量高
灵敏度高
不受物种限制
亚硫酸盐转化
PE150测序
《DNA methylation in mice is influenced by genetics as well as sex and life
胞嘧啶甲基化是哺乳动物最常见的DNA修饰形式。体细胞增殖过程中,甲基化模式的维持是亲子代细胞表观遗传的基础。而在生殖细胞和胚胎早期发育过程中,DNA甲基化会发生大规模的重编程。DNA甲基化对胚胎正常发育和等位基因的选择表达至关重要。有证据表明DNA甲基化模式在某种程度上受遗传控制,暗示了子女和父母之间存在相似的甲基化模式。
取材:
小鼠C57BL/6N 和C3H/HeN以及正反交F1后代。
高通量测序:
全基因组甲基化测序,30-35X。
生信分析:
全基因组甲基化水平分布趋势分析;差异性甲基化区域(DMRs)分析。
研究结果:
不同小鼠基因型C57BL/6N 和C3H/HeN的DNA甲基化差异位点有数千个,并且这些差异位点在F1后代是保守的。
比较不同性别小鼠的常染色体DNA甲基化模式,发现数百个不同的甲基化区域。
比较不同生活经历(妊娠史)的小鼠,发现CpG甲基化模式仅限于有后代的雌性小鼠。
图2. DNA甲基化模式在F1后代的亲本等位基因上重演。
这些结果证明了跨代CpG甲基化的稳定性,表明了CpG甲基化可能是生物体内对生命事件的表观遗传记录。
参考文献:
Grimm S, Shimbo T, Takaku M, et al. DNA methylation in mice is influenced by genetics as well as sex and life experience. Nature Communications. 2019, 10: 305, https://doi.org/10.1038/s41467-018-08067-z.